Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SMARCE1Q969G3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCE1Q969G3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms