Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BHMTQ93088 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BHMTQ93088 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms