Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAT3Q8TDW7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms