Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRSK1Q8TDC3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRSK1Q8TDC3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms