Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CARMIL3Q8ND23 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CARMIL3Q8ND23 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms