Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DTX3Q8N9I9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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DTX3Q8N9I9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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DTX3Q8N9I9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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DTX3Q8N9I9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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DTX3Q8N9I9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DTX3Q8N9I9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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