Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYNE4Q8N205 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms