Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC2Q8N158 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPC2Q8N158 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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