Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms