Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKAP1Q86WV1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKAP1Q86WV1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms