Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNMB4Q86W47 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms