Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR53Q7Z5U6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms