Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q71RC1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q71RC1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q71RC1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q71RC1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q71RC1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q71RC1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q71RC1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q71RC1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q71RC1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q71RC1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q71RC1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q71RC1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms