Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms