Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCBE1Q6UXH8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCBE1Q6UXH8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms