Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms