Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLHL35Q6PF15 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL35Q6PF15 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms