Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6P435 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6P435 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6P435 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms