Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP5Q6NZY7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms