Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PPP4R4Q6NUP7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms