Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HMBOX1Q6NT76 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms