Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CARMIL2Q6F5E8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CARMIL2Q6F5E8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms