Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SUMO4Q6EEV6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms