Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms