Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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