Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SUSD4Q5VX71 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SUSD4Q5VX71 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms