Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GARNL3Q5VVW2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GARNL3Q5VVW2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms