Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SOGA3Q5TF21 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOGA3Q5TF21 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms