Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms