Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SAMD9Q5K651 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SAMD9Q5K651 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms