Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TDRD12Q587J7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms