Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP13-3Q3SY46 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms