Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms