Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FHOD3Q2V2M9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms