Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECM1Q16610 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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