Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SLC18A3Q16572 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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