Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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PRR4Q16378 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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PRR4Q16378 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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PRR4Q16378 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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PRR4Q16378 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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PRR4Q16378 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PRR4Q16378 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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