Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPEGQ15772 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPEGQ15772 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms