Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARHGEF6Q15052 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARHGEF6Q15052 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
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