Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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ODF1Q14990 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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ODF1Q14990 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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ODF1Q14990 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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