Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms