Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
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SHROOM2Q13796 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
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SHROOM2Q13796 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
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SHROOM2Q13796 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHROOM2Q13796 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHROOM2Q13796 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
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