Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL1Q13616 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms