Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATMQ13315 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMQ13315 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMQ13315 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMQ13315 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMQ13315 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMQ13315 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMQ13315 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMQ13315 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMQ13315 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMQ13315 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMQ13315 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMQ13315 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMQ13315 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMQ13315 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMQ13315 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMQ13315 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMQ13315 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMQ13315 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMQ13315 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMQ13315 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMQ13315 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATMQ13315 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATMQ13315 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATMQ13315 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATMQ13315 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATMQ13315 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATMQ13315 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATMQ13315 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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