Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCGB2A2Q13296 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms