Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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CALCOCO2Q13137 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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CALCOCO2Q13137 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
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CALCOCO2Q13137 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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CALCOCO2Q13137 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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CALCOCO2Q13137 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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CALCOCO2Q13137 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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CALCOCO2Q13137 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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CALCOCO2Q13137 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CALCOCO2Q13137 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALCOCO2Q13137 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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