Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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IFT88Q13099 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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IFT88Q13099 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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IFT88Q13099 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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IFT88Q13099 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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IFT88Q13099 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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IFT88Q13099 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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IFT88Q13099 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IFT88Q13099 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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