Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK2Q13002 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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