Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
BNIP1Q12981 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BNIP1Q12981 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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