Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTP4A2Q12974 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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